Ultraman Blazar is een held met een groot rechtvaardigheidsgevoel, afkomstig van ‘M421’, een extragalactisch astronomisch object ver van de aarde. De hoofdpersoon, Gento Hiruma, is de kapitein van het Special Kaiju Reaction Detachment (SKaRD), opgericht door de Global Guardian Force (GGF) in een wereld waar kaiju-rampen een gangbare praktijk zijn. Wanneer hun sterke verlangen naar de macht om mensenlevens te redden weerklank vindt, verenigen de twee zich.