Het verhaal speelt zich af in een alternatieve wereld genaamd Geminar, waar landen eindeloze oorlogen hebben gevoerd met replica's van mensachtige Seikishi-wapens die ze in oude ruïnes hebben gevonden. De 15-jarige Kenshi Masaki, de halfbroer van Tenchi Muyo! hoofdrolspeler Tenchi Masaki wordt vanuit een andere wereld naar Geminar geroepen.