הסוכנת המיוחדת מגי בל, נולדה אל תוך משפחה של אוכפי חוק וחשה מחויבות עמוקה כלפי האנשים שהיא עובדת איתם וגם כלפי האנשים שהיא מגנה עליהם. השותף שלה, הסוכן המיוחד עומר אדום זידאן יוצא האקדמיה הצבאית ווסט פוינט ששירת במשך שנתיים כסוכן סמוי ברשות לאכיפת הסמים לפני שנבחר לשרת באף-בי-איי. על שניהם מפקחת הסוכנת המיוחד דינה מויזר שפועלת תחת לחץ בכל שעות היממה ומפעילה את סמכותה הבלתי מעורערת על פקודיה. מנהל מוקד העצבים של היחידה והעוזר של מויזר הוא ג'ובל ולנטיין, שמצליח לקרב אליו את כל חברי היחידה, ממפקדיו ועד הכפופים לו. הסוכנים המעולים האלו חוקרים בנחישות את המקרים בעלי החשיבות הגבוהה ביותר – פעולות הטרור, פשע מאורגן וריגול נגדי.
עונה שלישית לדרמת החקירות העוקבת אחרי מה שקורה בתוך האף-בי-איי בניו-יורק. יחידת העילית ישתמשו בכל היכולות, הכישרונות, החכמה והמומחיות שבידיהם כדי לשמור על תושבי העיר והמדינה.
גופות של 3 נשים נמצאות, ובחקירה מתגלה הדנ"א של הרוצח, אך מה שמוזר הוא שהדגימה תואמת אדם שהורשע ברצח ויושב בכלא כבר 8 שנים. מגי לא יודעת איך לספר לאו-איי על החבר החדש שלה.
גבר לבן נכנס למסיבה של מקסיקנים, מתחיל לירות, והורג שתי נשים. כיוון החקירה הראשון הוא פשע שנאה על רקע גזעני, אבל ככל שהחקירה מתקדמת, מסתמן שהמניע לירי היה אחר.
ילדה קטנה נחטפת מהוריה בבקתת נופש בהרים. תחילה נדמה שאין שום קשר בין החטיפה להוריה של הילדה, אך עם התקדמות החקירה מתחילים להתגלות סימנים מחשידים. מגי מגלה שנסטור הסתיר ממנו סוד גדול.
שני סוכני מכס נרצחים במהלך שוד מכלית אמוניה ממחסן בניו יורק. במהלך החקירה מתברר כי השוד קשור לכנופיות סמים בעיר, אך עם התקדמות החקירה נראה שהסכנה גדולה בהרבה משנדמה לחוקרים בהתחלה.
חבר קונגרס לבן נרצח בפרוור עשיר וצעיר שחור נרצח בשכונת עוני באותה צורה. תחילה נדמה לצוות שאין קשר בין המקרים, אך ככל שהחקירה מתקדמת הדברים מתחברים והצוות צריך לפעול מהר למניעת הרג נוסף.
עיתונאית צעירה נחטפת באמצע הרחוב. צוות החקירה אובד עצות בהתחלה, אך לאט לאט מתגלים פרטים הקושרים את החקירה לשחיתות ולעולם התחתון. בנוסף, לאחד החשודים בפרשה קשר רומנטי עם מנהלת צוות החקירה.
הצוות חוקר את מותו של מאבטח שנהרג במהלך שוד מזוין, ומגלה שהשוד דומה לסדרת מעשי שוד שבוצעו זמן קצר קודם לכן באזור אחר בעיר. טיפאני מתמודדת עם דילמה מול חבריה לשעבר במשטרה.
בעקבות התפוצצות חבילת נפץ בבית, הצוות מתחיל לחקור כיוון של טרור מקומי, אך עם התקדמות החקירה מסתבר שהמניע לפשע שונה לגמרי. ארין, אחותה הצעירה של מגי באה ללמוד בניו יורק, אך מגי מרגישה שמשהו לא בסדר.
רופאה נחטפת מחוץ לבית החולים שהיא עובדת בו. הצוות פותח בחקירה, אך כשנחטף רופא נוסף, החוקרים מנסים למצוא קשר בין האירועים. תוך כדי ניהול האירוע ג'ובל מקבל חדשות מדאיגות על בנו.
הצוות חוקר רצח של בעל חברת השקעות בוול סטריט על מדרגות בניין הבורסה. ידיעותיו של הסוכן סטיוארט סקולה שעבד בוול סטריט לפני שהצטרף לאף-בי-איי תורמות לחקירה.
הצוות פותח בחקירת ירי במסעדה אפריקנית. תחילה הכיוון הוא ירי על רקע גזעני או ירי המוני, אך החקירה מובילה לכיוונים אחרים. אליס, שעובדת בחדר המבצעים ועברה טראומה בעבר, מתקשה להתמודד עם הלחץ.
פרק סיום העונה. חמישה גברים אמידים נרצחים במהלך משחק פוקר. כיוון החקירה הראשוני הוא שוד, אולם עם התקדמות החקירה מסתבר שהמניע הוא אחר. לאיזבל יש הזדמנות לסגור חשבון ישן.
