קאטסוירה אגאטה הוא נער שקט ומאופק שכל חושו לכאב נעלם. חברתו, צ'ידורי טאקשירו, יכולה רק במעט לזכור את הימים לפני שקאטסוירה עבר את השינוי המשמעותי הזה. עכשיו, התנהגותו השאננה של קאטסוירה גורמת לו להפוך למטרה עבור הבריונים, המנצלים אותו בסכומים עצומים של כסף. אבל אגרופיהם בקושי מצליחים לגרום לו למצמץ, ורגשותיו רחוקים מאחיזתו.  עם זאת, קאטסוירה, צ'ידורי ועוד 4 נערים אחרים נחטפים ונאלצים להצטרף למערכת "'Kizuna" כ-"Kiznaivers" רשמיים. אלו הלוקחים חלק מחוברים דרך כאב: אם אחד מהם נפצע, האחרים ירגישו באופן שווה את אותו הכאב. אנשים אלה הופכים לעכברי מעבדה של מערכת שלמה. עם גורלם זה בזה, פשוטו כמשמעו, ה-"Kiznaivers" חייבים לחשוף את האני האמתי שלהם לכל סיכון אחר, או הרבה יותר מאשר רק את מערכת "Kizuna".