Tænk, hvis Superman aldrig havde eksisteret? ”Krypton” udspiller sig, to generationer før Supermans hjemplanet går under, og serien følger Seg-El, den legendariske superhelts bedstefar, som er fanget i et dilemma, der vedrører liv og død. Enten kan han redde sin hjemplanet, eller også må han lade den gå til grunde for at beskytte sit barnebarns fremtid.