Thomas Anderson er en af de mest berømte computerspildesignere. Hans store værk er kæmpesucces trilogien "The Matrix". Men der er noget galt i Thomas' verden. Nogle gange kan han skimte det ud af øjenkrogen. Alt er en lille smule forkert. En dag bliver Thomas kontaktet af en ung kvinde, der fortæller ham sandheden om hans situation. Thomas Anderson er ikke bare Thomas Anderson. Han er også Neo. Og "The Matrix" er ikke bare et computerspil. Det er tid til at tage den røde pille endnu en gang.