เรื่องราวหลังจากเหตุการณ์ของดิจิมอนแอดเวนเจอร์ อีก 5 ปีให้หลัง กลุ่มเด็กที่ถูกเลือกจากดิจิตอลเวิลด์ได้เติบโตขึ้นมา เข้าสู่เส้นทางที่ต้องการตามความฝันที่หวังไว้ ไทจิและยามาโตะ มีชีวิตที่ลุ่มๆดอนๆ ทำงานพิเศษหาเลี้ยงชีพ ควบคู่ไปกับการเป็นนักศึกษา จู่ๆ ก็เกิดเหตุการณ์บุคคลที่หมดสติ ซึ่งทั้งหมดนั่นก็คือเด็กที่ถูกเลือกในอดีตที่เติบโตเป็นผู้ใหญ่เริ่มล้มป่วยอยู่ในอาการโคม่าแบบไม่ทราบสาเหตุ ไทจิ, ยามาโตะ, ทาเครุ และ ฮิคาริ ได้ตามหาเบาะแสที่มาจนได้พบกับ เมโนอา เบลุชชี่ หญิงสาวที่วิจัยเกี่ยวกับดิจิมอนที่กำลังสืบหาคดีนี้อยู่เช่นกัน พวกไทจิได้พบกับดิจิมอนปริศนา อีออสมอน ซึ่งเป็นผู้ที่โจมตีเด็กที่ถูกเลือกจนล้มป่วยหมดสติ แต่จากการต่อสู้ของไทจิและยามาโตะครั้งนี้ เป็นการนำไปสู่บทสรุปเรื่องราวที่แท้จริงของการเติบโตเป็นผู้ใหญ่...