Berättelsen om Stargate SG-1 börjar ungefär ett år efter händelserna i långfilmen Stargate. Den börjar när USA:s regering får veta att en uråldrig utomjordisk ”stjärnport” (Stargate) är dörren till ett nätverk av sådana portar på en mängd planeter i galaxen. SG-1 är ett elitteam för flygvapnets specialförband, ett av mer än två dussin team som utforskar galaxen och försvarar sig mot utomjordiska hot.