Spin-off serii Fate/Stay Night z Illyasviel von Einzbern jako protagonistką, prowadzącą normalne, spokojne, szkolne życie, które przewraca się do góry nogami, gdy zmuszona jest ratować swoje miasto zamieniając się w "Magical Girl". Około miesiąc po wydarzeniach z pierwszego sezonu, dziewczyny dostają nową misję – uregulować rozchwianą pulsację Ziemi. Jednakże kiedy Illya próbuje ją wyciszyć za pomocą magii, dochodzi to nieprzewidzianych komplikacji...