기념비적인 이벤트의 축하 행사에 참석하기 위해 서두르는 잭과 친구들. 하지만 그 배후에 잭의 세상을 뒤엎을 반란이 준비되고 있다는 것은 꿈에도 알지 못했다.
테러 사건 뒤, 잭은 초토화된 도시의 병원에서 눈을 뜬다. 상황 파악을 위해 황급히 집으로 간 잭. 그때, 당국의 요원들이 잭을 찾아온다.
1년 뒤, VC3 소대가 임무 수행을 위해 달에 상륙한다. 한편, 문 체인즈 반란군은 코페르니쿠스 시티를 점령하기 위해 움직인다.
비극적인 참사와 마주한 잭. VC3 대원들과 겪었던 힘든 여정이 뇌리에 떠오르며, 에릭과 나눈 소중한 대화를 회상한다.
소대의 다음 임무는, 합동군보다 먼저 밥 스카일럼의 측근을 생포하는 것. 하지만 타깃과 대면한 잭은 충격적인 사실을 알게 된다.
쉴 새 없는 공격에 맞서 대원들이 분전하는 사이, 운명적인 만남을 겪은 잭은 흔들리는 마음을 다잡으려 하는데. 과연 잭은 필을 신뢰할 수 있을까?
윈디가 고다드 기지에 잠입한다. 한편, 마리의 안내를 받은 대원들은 달과 지구의 분쟁이 달 주민에게 어떤 영향을 미쳤는지 알게 된다.
악몽 같은 기억을 회상하는 필. 그때, 닥터 살라만드라가 나타나 급박한 소식을 전한다. 한편, 들람브르 기지에서 마리가 잭에게 본인의 과거를 얘기하려는데, 리스가 불쑥 끼어든다.
이난나가 미지의 병에 걸린다. 마리가 치료해 줄 사람을 알고 있지만, 목적지와는 반대 방향으로 가야 한다는데. 과연 대원들은 돌아가는 길을 택할 것인가.
대원들이 마침내 아가룸 시티에 도착하지만, 도시는 봉쇄되어 있었다. 한 명이라도 희생자를 줄이려는 잭이 독단적으로 행동에 나선다.
쇄도해 오는 L 존을 막기 위해 닥터 살라만드라가 잭과의 싸움을 멈춘다. 그리고 이 괴물을 저지할 방법을 고심하는 두 사람. 그때, 마리가 나타난다.
L 존이 거침없이 아가룸 시티로 진격해 오고, 대원들은 마리가 가진 신비한 힘의 정체를 밝히기 위해 애쓴다. 그러던 중, 기지의 시스템이 다운된다.
반란군과 합동군의 전투가 격화되고, 잭과 리스는 고통스러운 대면을 한다. 마리가 잭에게 어떤 절박한 부탁을 한다.
13년 전, 리스는 잭과 처음 만났다. 그리고 현재, VC3 소대는 목표가 있는 곳으로 가기 위해, 치열한 전투 지역 안으로 뛰어든다.
시간에 쫓기는 리스와 대원들. 그때, 생각도 못 한 재회가 이들의 임무를 방해한다. 마리와 잭이 그동안 있었던 일들을 회상한다.
필이 모든 진실을 알게 된 날의 이야기, 그리고 잭의 진짜 용도와 관련된 충격적인 정보를 잭에게 들려준다. 닥터 살라만드라는 리스에게 어떤 질문을 던진다.
L 존이 코페르니쿠스 시티를 포위한 사이, 조완과 두안이 리스를 풀어준다. 반란군과 충돌이 벌어지고, 이난나와 대원들은 힘든 결정을 한다.
목숨을 건 대치가 끝나려는 찰나, L 존이 움직이고 마리를 혼돈의 한복판 속으로 흡수한다. 과연 필과 잭은 늦기 전에 마리와 달을 구할 수 있을까?
