フォールング・スカイズは、ほとんどの世界が完全に機能不全に陥ったエイリアン攻撃の混乱した余波で始まります。最初の侵攻以来の6か月間で、少数の生存者が主要都市の外で結集し、反撃の困難な任務を開始しました。毎日が生存テストで、都市兵は保護下にある人々を守りつつ、占領したエイリアン軍に対抗する反乱キャンペーンに従事しています。