1999年9月13日。月面に廃棄されてた大量の核廃棄物質が大爆発を起こし、月はその軌道を外れ太陽系外の宇宙へと漂流をはじめた。大宇宙を果てしなく彷徨うこととなった月面基地ムーンベース・アルファのスタッフは、様々な宇宙の脅威にさらされることとなる。