ある殺人現場で検出された指紋が、アルカトラズ刑務所の元囚人で30年以上前に死亡したはずのジャックのものと一致。さらに、彼を捕らえようとする組織が動きだしていた。サンフランシスコ警察の刑事・レベッカは、歴史学者・ドクと共に捜査を開始する。