L’anime è ambientato “in un futuro vicino” nel quale su internet stanno comparendo delle strane entità chiamate “fantasmi ologrammi”. Hiro è un ragazzo che può vedere i Digimon grazie al Digivice che gli ha lasciato suo padre e insieme al suo Digimon Gammamon cerca di comprendere cosa ci sia dietro questi strani fenomeni, ritrovandosi sempre più dentro nel mondo dei Digimon.