Mengabaikan hukum alkimia membuat setengah anggota Edward Elric terpisah dari tubuhnya dan meninggalkan roh saudaranya Alphonse terikat pada baju zirah. Untuk mengembalikan apa yang hilang, saudara-saudara tersebut mencari Batu Filosofer. Musuh dan sekutu – militer korup, Homunculi, dan alkemis asing – akan mengubah jalur saudara Elric, namun tujuan mereka tetap tidak berubah dan ikatan mereka tak terputus.