סוכנת אף-בי-איי נעלמת ללא עקבות במהלך מצוד אחד רוצח סדרתי בבוסטון ונחשבת למתה. שש שנים אחרי כן היא נמצאת בבקתה בעיר, על סף מוות וללא זיכרון מהשנים של היעדרותה. כשהיא חוזרת הביתה היא מגלה כי בעלה התחתן שוב ושבנה גדל עם אישה אחרת, ואם זה לא מספיק, מקרי רצח נוספים מתרחשים סביבה.
אמילי מסיימת את השעייתה מהאף-בי-איי בעוד היא מנסה להשלים עם תוצאות מעשיה משתי העונות האחרונות. בעת שהיא דרוכה ולא סומכת על איש, אמילי רואה איומים בכל מקום ובוחנת את כולם.
בעקבות האירועים הקטלניים, אמילי במירוץ נגד הזמן על מנת למצוא ולהציל את ניק, בעזרתו של המודיע המסתורי שלו, קאי. כאשר היא מאתרת את מיקומו, אמילי מבינה שקונספירציה גדולה יותר מתרחשת ונותרת להתמודד עם האפשרות שניק נהרג.
ניק המבולבל והמסומם עד כדי שיתוק מתעורר במקום חשוך וסגור. בינתיים, בלי גופה שתהווה הוכחה, אמילי מסרבת לקבל את מותו של ניק ועושה עסקה על מנת לקבלו בחזרה, רק בכדי לגלות שדוקינס טמן לה מלכודת ושכולם בסכנה.
דרישתה של אמילי מהאף-בי-איי לחפש את ניק נתקלת בהתנגדות, דבר המוביל אותה לצאת בתכנית מסוכנת שתעמיד אותה פנים אל מול פנים עם האדם שיכול להוביל אותה לניק. בינתיים, אי שם באירופה, ניק מסומם ועובר עינויים פסיכולוגיים, החושפים רגשות אשם ואת חוסר הביטחון שלו כסוכן אף-בי-איי, כבעל וכאב.
אמילי מצייתת לבקשותיו של דוקינס בכדי שייקח אותה לניק, ומנצחת תוך כדי כך על תחבולה מחוכמת. בינתיים, רגשות האשמה והחרדה של ניק מאיימים למוטט אותו, והוא סוף סוף מתמודד עם השדים הפנימיים שרודפים אותו.
עינוייו של ניק ממשיכים אך הוא מגלה הזדמנות לנסות להמלט משוביו. קאל ואמילי נוסעים להציל את ניק ומתקרבים זה לזו לאורך הדרך. כשהם מגיעים למיקום המסתורי הם מוצאים ראיות שקשורות לחקירה של ניק מבוסטון, אבל אין סימן לניק.
אמילי עושה נסיון אחרון להחליף את הקבצים הגנובים תמורת ניק, ודורשת הוכחות לכך שהוא חייה. אך היא אינה מודעת לכך שניק נמלט מהחוטפים במרדף מרגש. ניק יוצר קשר עם האף-בי-איי, ואמילי מקבלת החלטה אמיצה להתעמת עם קאל על העבר שלו.
אמילי וניק חושבים על תוכנית לחדור אל מחנה הפליטים, וקאל מתחזה אל שומר מרידיאן בתקווה למצוא את ארמסטרונג ולהביא אותו לדין. בינתיים, קראון וגונרסן מתקרבים לחפרפרת של מרידיאן, ואורח לא צפוי מגיע אל החווה.
ניק עובד על מנת לשחרר את הפליטים וקאל מתעמת עם ארמסטרונג. כשגונרסן וקראון הולכים לעצור את סגן המנהל ווב, הם מגלים משהו קטלני. בינתיים, אמילי מנסה לרדת לחקר הפעילות של אליוט ועושה הכל כדי להגן על משפחתה.
אמילי וניק מתאחדים סוף סוף עם פלין בבוסטון, אבל איום הנשק הביולוגי של אליוט עדיין נותר בעינו. אמילי פונה לאמצעים קיצוניים ועושה החלטה מסוכנת בכדי להבטיח את בטחון משפחתה.
