בהשראת הנובלה המקורית של רוברט לואי סטיבנסון, ג'קיל והייד ממוקם בלונדון של שנות השלושים ועוקב אחר רוברט ג'קיל, נכדו של הנרי ג'קיל, במסעו לגלות את זהותו האמיתית, את ההיסטוריה המשפחתית האמיתית שלו ואת אופי 'קללתו' - שאביו המאמץ, ד"ר וישל נג'ראן, שולט בכוחותיו ע"י תרופות. המסע שלו לוקח אותו למקום אפל ובלתי סלחני, שכן האלטר-אגו שלו מסוגל לכל דבר. במקביל ישנם כוחות נוספים המנסים למצוא את ג'קיל ואת מקור כוחותיו.