Lorsque la Terre est attaquée par des forces rebelles, le principal suspect, un héritier insouciant, se joint à une unité spéciale pour trouver le véritable coupable sur la Lune.
Se réveillant à l'hôpital après l'attaque, Jack découvre que la ville est en ruines. Il se rue chez lui, en quête de réponses, où il reçoit une visite impromptue des autorités.
Un an plus tard, l'unité VC3 se pose sur la Lune pour accomplir sa mission. Pendant ce temps, les forces rebelles des Chaînes Lunaires tentent de prendre le contrôle de Copernicus.
Alors qu'une tragédie dévastatrice ravive des souvenirs de sa formation éprouvante avec l'unité VC3, Jack se remémore une conversation importante qu'il a eue avec Eric.
L'unité a une nouvelle mission : capturer un proche allié de Bob Skylum avant l'armée de l'Alliance. Jack fait une découverte troublante lorsqu'il se retrouve face à la cible.
Tandis que l'unité se défend contre d'incessantes attaques, Jack tente de se remettre de sa rencontre bouleversante. Peut-il faire confiance à Phil après tout ce temps?
Windy infiltre la base Goddard. Pendant ce temps, Mary sert de guide à l'unité, qui découvre l'impact du conflit entre la Terre et la Lune sur les habitants lunaires.
Alors que Phil se remémore un souvenir funeste, la Dre Salamandra lui annonce une nouvelle. À la base Delambre, Mary raconte son passé à Jack, mais elle est interrompue par Rhys.
Inanna est atteinte d'un malaise mystérieux. Mary connaît quelqu'un qui peut la guérir, mais pour ce faire, il faut changer de cap. L'équipe peut-elle se permettre un détour?
L'unité arrive enfin à Agarum, où elle se bute à un blocus. Dans l'espoir de minimiser le nombre de victimes, Jack décide de prendre les choses en main.
La Dre Salamandra abandonne son combat contre Jack pour arrêter une L-Zone qui saccage tout sur son passage. Alors qu'ils tentent de maîtriser l'entité, Mary apparaît soudainement.
Tandis que la L-Zone se dirige vers Agarum, l'unité est déstabilisée par la découverte de la mystérieuse faculté de Mary. Puis, la base devient compromise.
La bataille entre les forces rebelles et l'armée de l'Alliance se poursuit, et Jack se retrouve face à Rhys dans une confrontation déchirante. Mary lui fait une requête désespérée.
Treize ans plus tôt, Rhys rencontre Jack pour la première fois. Dans le présent, l'unité VC3 s'infiltre dans une zone de combat intense pour atteindre sa cible.
Le temps presse pour Rhys et son équipe, mais des retrouvailles imprévues perturbent leur mission. Plus tard, Mary et Jack repensent à tout ce qui s'est passé.
Phil relate le jour où il a appris la vérité et révèle des informations troublantes concernant le véritable dessein de Jack. La Dre Salamandra interroge Rhys.
Tandis que la L-Zone encercle Copernicus, Zowan et Duan libèrent Rhys. Lors d'un affrontement contre les forces rebelles, Inanna et l'unité font face à une décision difficile.
Après une bagarre mortelle, la L-Zone se déchaîne et absorbe Mary dans le chaos. Phil et Jack pourront-ils sauver Mary et la Lune avant qu'il ne soit trop tard?