Le pirate Burger Beard a mis la main sur un livre magique qui lui permet de s’emparer de la recette secrète du pâté de crabe de Monsieur Krabs. Privée de son mets favori, la communauté de Bikini Bottom sombre dans le chaos. Bob l’éponge et ses amis unissent leurs efforts à ceux de Plankton, leur ennemi juré, afin de récupérer le précieux document. Le groupe remontera même jusqu’à la surface et s’aventurera hors de l’eau, pour sauver Bikini Bottom de l’apocalypse.