Die Agenten des New Yorker Büro des FBI arbeiten rund um die Uhr daran, die Stadt und ihr Land vor Terror, organisiertem Verbrechen und fremden Spionen zu beschützen. Unter der Leitung von Special Agent in Charge Dana Mosier setzt sich ihr Team aus verschiedenen Spezialisten mit einzigartigen Fähigkeiten zusammen.
After a federal judge disappears, a routine investigation takes a dark turn as the team uncovers that the judge had been searching for his missing son on a secluded island on the city's edge, where authority has crumbled. Meanwhile, reality weighs heavy on Jubal as he takes on a new leadership role.
When paintings from a high-profile international cultural exchange are stolen – leaving a security guard dead – the team races to recover the priceless artworks. Meanwhile, Maggie turns to a friend for help profiling suspects.
After a young man is found beaten to death on federal land, Scola and Special Agent Eva Ramos hit a roadblock when their case intersects with a DEA operation. Meanwhile, there is a potential shake-up inside of the JOC.
Following a failed assassination attempt on a U.S. Senator, OA and Maggie are tasked with escorting her back to DC on a flight that becomes more perilous than imagined.
Maggie partners with Eva to hunt a killer after a shocking daytime stabbing in an NYC park. After a subsequent murder, they realize the assassin has a hit list, begging the question: "Who's on it and who's next?"
When a robbery at a community clinic turns deadly, the team investigates a drug trafficking crew and soon uncovers that the clinic's doctor may be more involved than they initially thought. Meanwhile, Isobel and her stepdaughter are at odds over a family issue.
When a large-scale explosion rocks a Brooklyn apartment complex, the team quickly locates the perpetrator and discovers he's acting on the orders of a convicted felon currently serving time. Meanwhile, Isobel must name her successor before she moves into her new role.
When a journalist is shot while interviewing a prime minister, all fingers point to an assassination attempt, but the team uncovers a deeper conspiracy after the assassin is also targeted.
As the holidays approach, the team finds three slain sex workers inside a brownstone - they uncover the murderer has a larger plan in place that they must rush to stop.
Chaos erupts in the city when an attack disrupts cell, internet and emergency services. As the team races to uncover the culprits, they learn the group responsible is a radical accelerationist movement fixated on resetting society.
After an undercover investigation goes sideways, the team tries to flip their only witness to help them hunt down a rip crew at a cartel wedding. Scola and Nina make a big life decision.
Als ein Whistleblower der Bundesbehörden zusammen mit zwei Agenten in FBI-Gewahrsam ermordet wird, ist das Team fassungslos, als es feststellt, dass ein bekannter Täter wieder aufgetaucht ist. Unterdessen ringt OA damit, dem Team zu erzählen, was in seinem Privatleben vor sich geht.
Nachdem der Sohn eines Profi-Basketballteam-Besitzers entführt wurde, um Lösegeld zu erpressen, machen sich Jubal und das Team auf die Jagd nach den Entführern. Bald stellen sie fest, dass die Täter einen noch größeren Racheplan geschmiedet haben, den sie nur durch schnelles Handeln verhindern können.
Nachdem Maggies Schwester Erin verschwunden ist, startet das Team eine groß angelegte Suchaktion, um sie zu finden. Doch als Maggie herausfindet, dass Erin von einer finsteren Gestalt aus ihrer Vergangenheit entführt wurde, muss sie sich beeilen, um sie zu retten, bevor es zu spät ist.
Ein gefährlicher Drogenboss aus Evas Vergangenheit taucht wieder auf, als zwei Kinder und eine Erzieherin durch einen versehentlichen Kontakt mit Drogen ums Leben kommen. Während das Team an dem Fall arbeitet, schwankt Eva zwischen ihrer Aufgabe als Agentin und ihrer persönlichen Rache.
Ein Doppelmord in Brooklyn führt das Team auf die Spur eines korrupten Hafenarbeiters, doch schon bald entdecken sie, dass etwas Unheimliches nach New York geschmuggelt wurde. Während sie gegen die Zeit kämpfen, um die Bedrohung abzuwenden, bittet Isobel die stellvertretende CIA-Stationsleiterin Nikki Reynard um Hilfe.
Als der Körper eines Psychiaters der Veteranenbehörde gefoltert und tot unter einer nahegelegenen Überführung gefunden wird, führt die Spur das Team zu einem verdächtigen religiösen Führer mit starker Online-Präsenz. Unterdessen baut OA eine Beziehung zu Special Agent Zara Ushruf auf, die bei dem Fall hilft.
Als eine alleinerziehende Mutter und ihr Sohn während eines Besuchs in einem State Park entführt werden, zieht Maggie Peter Olsen hinzu, um ein Profil des Verdächtigen zu erstellen. Doch während das Team an dem Fall arbeitet, machen sie eine erschütternde Entdeckung in Bezug auf einen alten Fall.
Als ein FBI-Beweismitteldepot ausgeraubt wird und dabei ein ERT-Agent ums Leben kommt, stößt das Team auf ein Selbstjustiz-Duo, das einen hochrangigen Pädophilenring zerschlagen will. Unterdessen lernt Isobel den neuen stellvertretenden Leiter kennen.
Als eine großzügige Spenderin aus der Großstadt in ihrer Wohnung ermordet wird, spürt das Team den jungen Mörder auf, der sie zu einem Kryptowährungsbetrug führt, den er gemeinsam mit einem seiner Opfer betrieben hat, um Rache an dessen Familie zu nehmen.
Nach der Ermordung eines hochrangigen Unternehmensleiters macht sich das Team auf die Suche nach den Anführern einer bisher inaktiv gebliebenen Terrororganisation, die nun wieder aktiv geworden ist. Unterdessen wird OA vorübergehend versetzt, nachdem sie sich geweigert hat, Befehle zu befolgen, wird jedoch mit einem bekannten Gesicht zusammenarbeiten.
Der Diebstahl einer Biowaffe von einem ahnungslosen Überläufer zwingt das Team dazu, mit einem alten Feind zusammenzuarbeiten, um den tödlichen Erreger sicherzustellen und einen Ausbruch in ganz New York City zu verhindern.