Serien handler om de eventyr som Doktoren tager på. Han udforsker universet i sin TARDIS, et følende tidsrejsende rumskib. Udvendigt ligner den en telefonboks, men det er meget mere end det. Sammen med et udvalg af ledsagere, går Doktoren op mod forskellige fjender mens han arbejder på at redde civilisationer, hjælpe almindelige folk, og rette op på fejl.