Den tjetjenske nationalist Basayev får kontrollen over Tjernobyl, det tidligere atomkraftværk, og truer med at udløse en radioaktiv sky ved hjælp af sprængstoffer, medmindre hans nationalistiske krav bliver indfriet. Luc Deveraux og et team af genoplivede UniSoldiers får til mission at stoppe Basayev, inden det er for sent. Deveraux får hjælp til opgaven af en genaktiveret UniSoldier, som er en klon af hans gamle sergeant Andrew Scott.