Den Første Cylon Krig har raset i 10 år, da den unge Ensign William Adama slutter sig til flåden. Han er skuffet over ikke at skulle flyve et jagerfly men derimod et transportfly. Hans andenpilot er ikke begejstret for at en nybegynder skal flyve hans fly, da han ikke har lang tid tilbage, før han forlader flåden. Ombord på flyet har de en civil videnskabsmand, dr. Becca Kelly, som udsteder nye ordrer og en ny destination, lige så snart de er lettet. Hun er ikke meget for at røbe, hvad hendes hemmelige mission består i, men Adama adlyder gerne, da hun fører dem ind i territorier, der er kontrolleret af Cylon.