Ash tror måske, at han har set det hele – men når det drejer sig om Pokémon, er han så klar til at stå ansigt til ansigt overfor den mystiske Darkrai? I selskab med den smukke Alice, vandrer Ash og hans venner igennem byen Alamos – hvor tid/rum-tårnet står – og de opdager, at byens særlige have er blevet ødelagt! Baron Alberto, en elegant men arrogant fyr, bebrejder Darkrai for ødelæggelserne. Pludselig dukker Darkrai op og konfronterer vores helte! Hvem er Darkrai? Er det en fjende – eller ven i forklædning? Vil Ash og hans venner overleve og lære Darkrais sande natur at kende, mens slaget mellem den legendariske Pokémon Dialga og Palkia raser over byen Alamos?