My Little Pony Filmen bringer for første gang ponyerne ”Mane 6” til live på det store lærred i en skøn familiefilm om det magiske i venskab. I filmen kommer de 6 venner op imod den onde Storm King, der sammen med sine håndlangere vil stjæle al magien i kongedømmet Equestria. For at stoppe ham og redde deres elskede hjem, må ponyerne forlade Equestria for første gang og kaste sig ud i et fantastisk eventyr, der byder på masser af nye venner, som uforglemmelige pirater, sø-ponyer og magiske skabninger. På rejsen lærer de, at helte ikke behøver stå alene, og at nogle udfordringer løses bedst med gode venner ved din side.