Den livlige Boruto Uzumaki, søn af den syvende Hokage Naruto, er en dygtig ninja, der besidder den samme frækhed og passion, som hans far engang havde. Men hans fars konstante fravær, som er optaget af sine Hokage-pligter, lægger en dæmper på Borutos ild. Han ender med at møde sin fars ven Sasuke og beder om at blive... hans lærling!? Tæppet for den nye generations historie går op!