Seriál sleduje práci členů newyorské pobočky Federal Bureau of Investigation (FBI, Federální úřad pro vyšetřování). Tito prvotřídní agenti spojují talent, intelekt a technické dovednosti, aby za pomoci pokročilých technik vyšetřovali případy s velkým dopadem, a to včetně terorizmu, organizovaného zločinu a vnitřních konspirací. Jejich cíl je jediný: udržet New York a zbytek země v bezpečí.
Na cestě domů z bujarého večírku na jachtě je zabita mladá žena a podezřelý je identifikován jako veterán, který se s Crosbym účastnil několika armádních operací.
Maggie, OA a tým musí zastavit hackera, který v několika newyorských nemocnicích vyřazuje život zachraňující zařízení; v jedné z postižených nemocnic čeká Jubalův syn na důležitou operaci.
Poté, co tým zjistí souvislost mezi bombovými útoky ve vládních agenturách a soukromým klubem veteránů v New Yorku, řekne Isobel OA, aby pro informace získal svého bývalého kamaráda z armády Chrise, který v klubu tráví čas. Protože však ví, s jakými problémy se vojáci jako Chris často potýkají při návratu do civilního života, OA se zdráhá splnit rozkaz.
Tým pátrá po sériovém vrahovi, který se zaměřuje na mladé muže bez domova. Také Tiffany a Scola se neshodnou na tom, jak případ řešit, ani na rozdílu mezi partnery a spolupracovníky.
Poté, co je z domova unesena žena z předměstí, se tým zabývá zálety na obou stranách zdánlivě dokonalého manželství. OA cítí tlak ze strany Mony, aby udělal změny ve své kariéře.
Tým musí vypátrat střelce, který se zaměřil na detektivy ze stejného okrsku a jednotky, a zároveň čelí rostoucímu napětí ze strany newyorské policie. Tiffany zjišťuje, že její kořeny u newyorské policie možná ovlivňují její pohled na situaci.
Poté, co je ze školky unesena mladá dívka, musí tým pomoci jejím rodičům vyřešit dluh vůči smrtícímu gangu v jejich sousedství. Maggie se snaží soustředit na případ, když se její sestra Erin vrátí z léčebny.
Tým se pokouší získat klíčové informace od zranitelné vdovy Hannah Thompsonové, která je šokována tím, že její nový "přítel" je manipulativní vůdce teroristické skupiny plánující útok. Scola si připomene smrt svého bratra z 11. září a Tiffany se obává jeho citových rozhodnutí během vyšetřování.
Poté, co je Rina při cestě do práce s Jubalem kriticky zraněna, tým učiní mrazivé zjištění, že střelbu zpoza mříží zorganizoval pomstychtivý Vargas (David Zayas), který se nadále zaměřuje na zbytek jejich týmu a jejich blízké.
Když tým vyšetřuje sérii loupežných přepadení klenotnictví, která vyvrcholí dvojnásobnou vraždou, odhalí spojitost s šestnáctiletým chlapcem, který se snaží přežít v systému náhradní péče. Tiffany se stane osobně zainteresovanou poté, co se dozví o chlapcově neblahé výchově.
Zatímco tým pátrá po unesené vysokoškolačce, Jubal začne usilovat o získání životně důležitých stop od otce předchozí oběti únosce. Jubal se také nadále potýká s následky Rinina zranění, což vede k napjatému setkání s její matkou.
Maggie se v utajení vydává pracovat do baru, aby vyšetřila protivládní skupinu, která se tam pravidelně schází a jejíž několik členů je podezřelých ze série bombových útoků. Případ jí otevře staré rány, když se osamělý otec na periferii skupiny začne obávat, že mu hrozí, že se stane další obětí.
Když jsou zavražděni muslimský vysokoškolský student a jeho mladší bratr, spojí se tým s rozhořčeným imámem bývalé mešity OA, který trvá na tom, že oběti byly neprávem označeny za teroristy. OA také musí přehodnotit svou loajalitu, když pracuje na případu s muslimským protiteroristickým agentem, který chce vyšetřování vyřešit jakýmikoli prostředky.
Tým spěchá s vyšetřováním extremistické skupiny bojující proti zbraním poté, co je vybombardována budova lobbistů bojujících proti zbraním, a slibuje, že další budou následovat. Velící důstojník Bashar se ohání možným povýšením pro OA, ale pouze pokud se mu podaří přesvědčit Tiffany, aby nenahlásila incident, který považovala za přestupek.
Tým si uvědomí, že má na krku sériového vraha přes celou zemi, poté co je nalezeno další tělo svázané stejně důmyslným uzlem jako jejich místní oběť. Případ má také vazby na Isobelina otce Roberta a jeho hotel, což vede k odhalení jejich narušeného vztahu.
Poté, co je na hokejovém zápase ICE vs. DEA smrtelně postřelen agent ICE, se tým snaží najít střelce, o němž se domnívají, že by mohl mít za cíl i kongresmana Curtise Grange, který byl na stejném zápase.
Když je v newyorském parku po návratu z dovolené nalezen zavražděný mladý pár, pátrá tým po podezřelém spojeném s obchodem s drogami. Scola obrací list, pokud jde o jeho vztahy.
Když je ve svém domě zavražděna moderátorka ranní show, tým vypátrá vraha, který, jak si uvědomí, se zaměřuje na vlivné ženy. Pro Scolu se situace stane nepříjemnou, když se během Maggiina zotavování stane součástí týmu zvláštní agentka Nina Chaseová.
Vražda agenta TSA vede tým k pátrání po vrahovi, který využívá drogové muly k zneužívání letištních bezpečnostních kontrol. OA se snaží vyrovnat s následky vystavení plynu sarin a s desátým výročím smrti svého kamaráda z armády v Afghánistánu.
Když je před pekárnou zastřelen vysloužilý agent DEA, tým se snaží zjistit, zda s vraždou souvisí minulé případy oběti nebo její současná práce vyhazovače. Nina a Tiffany se střetnou kvůli využití informátora, zatímco jsou během vyšetřování ve dvojici.
