小班得到Omnitrix的升級版Ultimarix以後，擁有更強大的變身能力，可以將之前變身的外星生物轉變為更強大的版本。另一方面，小班原本的秘密身份曝光讓大眾以不同於過去的眼光看他。小班除了要面對與茱莉關係的變化，還要面對過去的舊敵人和未知的新敵人。 第一季的劇情主線在阻止惡怪剋的計畫，主要敵人為惡怪剋。第二季沒有特定的主要敵人，有多集敘述各角色本身的故事。後期原本衰弱的永恆武士重振實力，異界生物大剛也將構成嚴重威脅。