號稱史上最凶惡的超生物「殺老師」將月球炸掉了七成，並揚言明年要炸掉地球，卻因不明目的而擔任椚丘中學3年E班的教師。各國首腦將暗殺重任交給椚丘中學3年E班，為他們配送特製武器，希望學生們能在一年之內消滅殺老師，報酬是一百億日元。從第二學期開始，國家決定讓暗殺成功者獨得一百億日元報酬，協力團體共享三百億日元報酬。 全班同學想盡辦法殺死老師，故事就圍繞著這樣非日常的校園生活而展開。