「潮死了。」聽聞自己的青梅竹馬 ── 小舟潮的死訊後，網代慎平回到了闊別兩年的故鄉，和歌山市的日都島。與家人和朋友再次見面，葬禮也如期舉行。但摯友菱形窗卻告訴他：「潮的死有疑點，可能是他殺。」第二天又發生了附近一家人突然全家消失的事件。與此同時，慎平聽到了一個不祥的傳聞。「看到與自己一模一樣的『影子』的人就會死去。會被影子所殺害！」而且，潮的妹妹澪竟然也說：「姊姊在去世的三天前看到了影子。」在紀淡海峽中的一座夏日小孤島上，一部跨越時空的科幻懸疑動畫，即將拉開帷幕。