接續電影《復仇者聯盟2：奧創紀元》的故事情節，在《美國隊長3：英雄內戰》中美國隊長繼續帶領著復仇者們保護世界的和平。然而在某次的任務中，意外造成無辜生命的犧牲，使得「美國隊長」和「鋼鐵人」對於超級英雄是否應該被政府管制的看法出現嚴重歧異，進而導致復仇者聯盟的分裂。 另一方面「獵鷹」在尋找失蹤人口時，尋獲了「酷寒戰士」並揭露他可能就是殺害鋼鐵人父母的元兇，使得局面陷入更複雜難解的狀態，而此時齊莫卻再度現身攪局……