Dizi, rahibe Cathy Cesnik’in hikayesini anlatan bir belgeseldir. Baltimore kasabasında geçen hikayeye göre Cathy Cesnik, Katolik Okulu’nda öğretmendir. Bir gün esrarengiz bir şekilde ortadan kaybolur ve iki ay sonra cesedi bulunur. Rahibenin ölümü bir sır olarak kayıtlara geçer. The Keepers izlerken bu ölümün ardında yatan korkunç olaylara tanık olacaksınız. Yıllar sonra gizli bir tanık papaz tarafından cinsel istismara uğradığına dair ve Cathy’nin ölümüyle ilgili olaylar hakkında ifade verir. Bunun üzerine rahibenin ölümünün ardındaki korkunç sır, güç sahiplerine rağmen aydınlatılmaya çalışılır.