ในปี 2020 เครือข่ายอินเทอร์เน็ตกลายเป็นสิ่งที่มนุษย์ไม่สามารถขาดได้ในชีวิตประจำวัน แต่สิ่งที่มนุษย์ไม่รู้ก็คือ ในอีกด้านหนึ่งของเครือข่ายนั้นคือโลกดิจิทัล ดินแดนแห่งแสงสว่างและความมืด อีกทั้งยังมีดิจิมอนที่อาศัยอยู่ที่นั่นด้วย วันหนึ่ง ยางามิ ไทจิ นักเรียนประถมปีที่ 5 ต้องพบกับเหตุการณ์ไม่คาดฝัน เมื่อแม่และน้องสาวของเขา ฮิคาริ เดินทางไปชิบุยะ และติดอยู่บนรถไฟที่ควบคุมไม่ได้! ไทจิจึงรีบมุ่งหน้าไปที่ชิบุยะเพื่อช่วยทั้งสอง แต่ทันทีที่เขาก้าวเข้าสู่ชานชาลาสถานี ก็เกิดปรากฏการณ์ประหลาดที่พาเหล่าเด็กผู้ถูกเลือกไปยังโลกดิจิทัล!