การละเลยกฎของอัลเคมีทำให้ขาดแขนขาของเอ็ดเวิร์ดเอลริคครึ่งหนึ่ง และทำให้จิตวิญญาณของพี่ชายอัลฟอนเซ่ติดกับชุดเกราะ เพื่อฟื้นฟูสิ่งที่สูญเสียไป พี่น้องค้นหาหินปรัชญา ศัตรูและพันธมิตร – กองทัพทุจริต, โฮมุนคูลัส, และนักเคมีต่างชาติ – จะเปลี่ยนแปลงเส้นทางของพี่น้องเอลริค แต่เป้าหมายของพวกเขายังคงไม่เปลี่ยนแปลงและสายสัมพันธ์ของพวกเขาไม่หายไป.