เมื่อชาวดาววัลแคนเชื่อว่า ไซบ็อก (ลอเรนซ์ ลุคคินบิล) ได้จับบรรดาทูตจากหลายดวงดาวเป็นตัวประกันไว้บนดาวชื่อ นิมบัส 3 ดดยมีจุดประสงค์เพื่อต่อรองในการค้นหาดาวชื่อ ชาคารี ซึ่งเชื่อว่าที่นั่นเป็นจุดกำเนิดแห่งทุกชีวิต การเดินทางค้นหาดาวดวงอันเป็นที่ซ่อนความลับลึกสุดของจักรวาลจึงเกิดขึ้น พร้อมๆ กับ กัปตันเคิร์ก (วิลเลี่ยม แชตเนอร์) ยังต้องพยายามช่วยเหลือตัวประกันเหล่านั้นไว้ให้ได้อีกด้วย