สองปีให้หลังการนำทัพออกไปต่อสู้กับเซฟิรอธผู้ชั่วร้าย คลาวด์ถูกชุบชีวิตกลับมาอีกครั้งหลังจากการโจมตีของสามพี่น้องลึกลับ