Falling Skies öppnar i den kaotiska efterdyningarna av ett utomjordiskt angrepp som har gjort det mesta av världen helt oförmögna. Under de sex månader som har gått sedan den första invasionen har de få överlevande samlats utanför de stora städerna för att påbörja den svåra uppgiften att slå tillbaka. Varje dag är ett test av överlevnad när medborgarlegionen skyddar människorna i deras vård och samtidigt driver en upprorisk kampanj mot den ockuperande utomjordiska styrkan.