Michelangelo, Donatello, Leonardo a Raphael sú späť, teda presnejšie povedané prichádzajú v novej podobe. Tretie seriálové spracovanie pôvodne komiksového konceptu Kevina Eastmana a Petera Lairda prináša úplne nové poňatie štvorice zmutovaných korytnačiek vycvičených v japonských bojových umeniach. Samotní štyria hrdinovia v pancieroch sú profilovaní nie ako nebojácni bojovníci, ale skôr ako chlapci, ktorí postupne spoznávajú svet okolo seba a učia sa zdokonaľovať svoje schopnosti. April O'Neilová je tu šestnásťročné dievča, ktoré sa náhodou s korytnačkami skamarátilo a vďaka výcviku pod vedením majstra Triesky často hrdinom výrazne pomáha. V rôzne pozmenenej podobe sa objavujú aj tradiční zlosynovia na čele s Trhačom a mimozemským zločincom Krangom.