Všetko sa to začalo pádom lietadla, no ktorého palube nastala podivná nehoda. Všetci ľudia na palube zomreli. Do prípadu je zapojená agentka FBI Olivia Dunham, ktorá však odhaluje to, že do tohto zvláštneho prípadu sú zapojení ľudia aj z vyšších vládnych miest. Zdá sa, že tragický let je len malou časťou omnoho väčšej a šokujúcejšej skutočnosti.