Zanedbanie zákonov alchymie roztrhlo polovicu končatín Edwarda Elrica a nechalo dušu jeho brata Alphonse pripnutú k zbroji. Aby sa vrátilo, čo bolo stratené, bratia hľadajú Filozofský kameň. Prijatelia a nepriatelia – korumpovaná armáda, Homunkuli a zahraniční alchymisti – zmenia smerovanie bratov Elricov, ale ich cieľ zostane nezmenený a ich väzba nezlomiteľná.