Khan, geneticky upravený „nadčlovek“ s megalomanským sklonmi, bol po porážke v eugenických vojnách vyhnaný na opustenú planétu Ceti Alpha 5. Prisahal pomstu kapitánovi Kirkovi, ktorého viní za svoje vyhnanstvo ako aj za smrť svojho syna. Keď sa mu po dlhých rokoch naskytne možnosť utiecť, neváha. S pomocou tvora ovládajúceho myseľ získava čoskoro kontrolu nad celou loďou Reliant. Teraz už Khanovi zostáva len jediná vec, prilákať Kirka a zabiť ho. Ako nástroj svojej pomsty sa chystá použiť zbraň naozaj ničivú – strelu „Genesis“.