É o ano 2020. A Rede tornou-se algo de que os humanos não conseguem mais prescindir nas suas vidas diárias. Mas o que os humanos não sabem é que do outro lado da Rede está o Mundo Digital, um reino de luz e escuridão. Também não têm consciência dos Digimon que lá habitam. Dificuldades generalizadas na Rede surgem, centradas na área de Tóquio. Os semáforos piscam de forma caótica, os televisores públicos ao ar livre exibem textos incompreensíveis, e assim por diante. As notícias reportam como um caso de ciberterrorismo. O aluno do quinto ano, Yagami Taichi, ficou em casa sozinho para se preparar para um acampamento de verão no fim de semana, mas a sua mãe e a sua irmã mais nova, Hikari, foram a Shibuya, e agora estão a bordo de um comboio descontrolado. Taichi apressa-se para Shibuya para salvar a sua mãe e a sua irmã, mas assim que se dirige para a plataforma da estação... um fenômeno estranho ocorre com os DigiDestinados, e Taichi vai para o Mundo Digital!