Emiya Shirou é um estudante que vive na cidade de Fuyuki . Os seus pais morreram quando ele tinha cinco anos de idade, depois foi adoptado por um homem que se auto-intitulava como mago, que também veio a falecer. O que Shirou não sabe é que em Fuyuki é palco de uma grande guerra. De dez em dez anos sete magos de todo mundo juntam-se aos seus servos - espíritos de heróis, invocados de outra era - e lutam em uma guerra pelo "Cálice Sagrado" , uma relíquia que garante grandes poderes ao seu dono. O verdadeiro nome dos seus serventes são sua fraqueza, então eles são chamados apenas pela classe a qual pertence; Archer (Arqueiro), Assassin (Assassino) e etc.