Uma importante pesquisa sobre animais marinhos se desenvolve num instituto localizado na região do sul da Flórida, onde um grupo de cientistas estuda o sonar dos golfinhos, chefiando a equipe, está o Dr. Keith Ricks, eterno apaixonado pela vida marinha e que não esquece seu grande amigo de infância, Flipper. Sua companheira de pesquisa é a doutora Pam Blondel, uma mulher divorciada que tem um filho de 14 anos chamado Mike, que está sempre em companhia de Maya, uma garota local e de um golfinho brincalhão e inteligente que será o objeto central de uma vibrante aventura.