Kiedy do wioski Rakiego przybywa zmiennokształtny demon żądny ludzkiego mięsa, znany jako youma, do miasta wchodzi samotna kobieta o srebrnych oczach, niosąc na plecach jedynie miecz. Jest ona Claymore — istotą stworzoną w połowie z człowieka, a w połowie z youmy, powołaną do życia w jednym celu: by eksterminować te potwory. Po tym, jak rodzina Rakiego zostaje zabita, Claymore ratuje mu życie, jednak chłopak zostaje wygnany z domu. Nie mając dokąd pójść, odnajduje wojowniczkę, która nosi imię Clare, i decyduje się towarzyszyć jej w wędrówce. Podróżując razem od miasta do miasta i pokonując kolejne youmy, Raki i Clare odkrywają coraz więcej o organizacji Claymore oraz innych wojowniczkach. Z każdym oczyszczonym miastem i każdym pokonanym demonem Clare zbliża się do youmy, na której pragnie się zemścić — od dnia, w którym zdecydowała się zostać Claymore.