W roku 2138 gry w wirtualnej rzeczywistości rozkwitają. Yggdrasil, popularna gra online, zostaje cicho wyłączona pewnego dnia. Jednak jeden gracz, o imieniu Momonga, postanawia nie się wylogować. Momonga zostaje wtedy przemieniony w szkielety, jako "najpotężniejszy czarodziej". Świat dalej się zmienia, a postacie niezależne (NPC) zaczynają odczuwać emocje. Nie mając rodziców, przyjaciół ani miejsca w społeczeństwie, ten zwykły młody człowiek, Momonga, dąży do przejęcia nowego świata, którym stała się gra.