Seria przedstawia pracę FBI, stacjonującego w Nowym Jorku. Głównymi bohaterami są agentka specjalna Maggie Bell oraz jej partner Omar Adom, którzy dzielnie walczą z nowojorską przestępczością.
W restauracji w Queens, w której jadał w młodości QA, wybucha bomba. Zdarzenie początkowo wygląda na zamach terrorystyczny, ale sprawa okazuje się bardziej skomplikowana. OA musi działać pod przykrywką.
Uprowadzono syna znanej blogerki parentingowej i zespół musi przyjrzeć się dwóm milionom jej fanów, aby znaleźć sprawcę. Kristen przyzwyczaja się do pracy agentki terenowej w towarzystwie nowego partnera, Stuarta Scoli.
Valerie Caldwell, czołowa kandydatka na prezydenta, zostaje zaatakowana. OA i Maggie podejmują wyścig z czasem, by wytropić sprawcę. Przypadek każe im zastanowić się nad prawdziwym powodem zamachu.
Po strzelaninie w klubie okazuje się, że FBI mogło zignorować wcześniejsze groźby grupy białych supremacjonistów. Kristen jest rozdarta między swoją pracą a poczuciem odpowiedzialności wobec własnej społeczności.
Jim Russo to kochający mąż i ojciec dwójki dzieci, który zostaje porwany po przypadkowym wplątaniu się w nielegalne interesy. Jubal musi podjąć trudną decyzję dotyczącą swojej rodziny oraz jej przyszłości.
Kiedy ginie inwestor z Wall Street, zespół wpada na trop grupy zajmującej się handlem poufnymi danymi, która wykorzystuje niekonwencjonalne metody pozyskiwania informacji. OA nie jest pewny swojego związku z Moną.
Ginie członek zarządu firmy z branży medycznej, która miała wyjść na giełdę. Zespół zastanawia się, komu zależało na tej śmierci. Ktoś z rodziny prosi OA o przysługę, która wiąże się z koniecznością mówienia nieprawdy.
Kiedy zespół bada okoliczności wypadku samochodowego, w wyniku którego ginie fotograf, wychodzą na jaw zaskakujące fakty. Maggie współczuje wdowie po mężczyźnie, gdy przypomina sobie śmierć własnego męża.
Nauczyciel Patrick Miller znika bez śladu. Zespół musi sprawdzić każdego, kto mógł być do niego wrogo nastawiony. Maggie robi wszystko, by zapewnić bezpieczeństwo kluczowemu świadkowi, który zgłasza się do pomocy.
Była ofiara porwania zostaje powiązana z serią morderstw, w które zamieszana jest córka detektywa nowojorskiej policji. Kristen zaczyna wątpić w swoje umiejętności, kiedy jej ćwiczenia nie idą zgodnie z planem.
Po napadzie na bank ekipa odkrywa skrytkę depozytową, której zawartość zagraża bezpieczeństwu narodowemu. Kristen nie może się doczekać powrotu do pracy w terenie, podczas gdy inni członkowie zespołu wciąż mają obawy.
Kiedy syn emerytowanego agenta FBI zostaje porwany, motywem może być zemsta. Zespół musi odkryć, czy wydarzenie ma związek z przeszłością agenta, czy też syn sam wpadł w kłopoty. Isobel musi podjąć trudną decyzję.
Prokurator zostaje znaleziony martwy niedaleko zwłok prostytutki. Ekipa ustala, co łączy te dwie pozornie przypadkowe ofiary. Powiązania Jubala z jedną z ofiar sprawiają, że sprawa przybiera dla niego osobisty wymiar.
Porwano ciężarówkę wypełnioną karabinami przeciwpancernymi. Ekipa musi dowiedzieć się, kto jest sprawcą i jakie są jego plany. Dawny przyjaciel OA powraca, aby pomóc przy sprawie, jednak agent nie wie, czy może mu ufać.
Policja ignoruje błagania o pomoc zdesperowanego ojca. Ten porywa córkę miliardera i postanawia przetrzymywać jako zakładniczkę w szczelnej kryjówce, dopóki nie zostanie mu zwrócone jego dziecko.
Zespół zostaje wezwany na miejsce zbrodni i zaczyna podejrzewać motywy polityczne. Gdy jednak dochodzi do kolejnego zabójstwa, ekipa musi ustalić wspólny wątek. Maggie rozważa decyzję, która może zaważyć na jej karierze.
Jess LaCroix i jego zespół pomagają OA znaleźć uciekiniera. Jest nim mężczyzna, którego LaCroix aresztował przed laty jako głównego podejrzanego w sprawie zniknięcia autobusu z 26 studentami.
Znaleziono zwłoki studenta college'u i ekipa FBI analizuje przebieg nieudanej transakcji narkotykowej. Detektyw Hailey Upton tymczasowo dołącza do zespołu i odkrywa, że jej metody śledcze nie pasują do tutejszych zasad.
