Tym razem Rocky, Colt i Tum Tum, młodociani wojownicy ninja z Kaliforni, podczas wakacji u dziadka zaprzyjaźniają się z młodą Indianką o imieniu Jo. Dziewczyna prosi ich o pomoc w walce ze skorumpowanym biznesmenem, który wypowiedział wojnę członkom jej plemienia. Uzbrojeni po zęby trzej młodzi ninja wyruszają na wyprawę do fortecy nieprzyjaciela - gigantycznej fabryki, w której stawią czoła wrogom Jo.