I dette Ninjago-eventyret for storskjermen kaller slaget om Ninjago City den unge Loyd, også kjent som Green Ninja, til handling, sammen med vennene hans, som alle er hemmelige krigere og LEGO Master Builders. Gjengen ledes av kung fu-mester Wu, som er like spøkefull som han er vis, og de må beseire den onde krigsherren Garmadon , den verste-personen-noensinne, som tilfeldgvis også er Lloyds far. Denne episke konfrontasjonen setter mekanisk drakt mot mekanisk drakt og far mot sønn, og vil sette på prøve det slagkraftige, men udisiplinerte teamet av moderne ninjaer, som må lære å kontrollere egoene sine og jobbe sammen for å frigjøre sin sanne kraft.