Befolkningen i den lille byen Cedar Creek, California er i ferd med å bli syke, alvorlig syke. Et dødelig virus, som stammer fra de afrikanske regnskogene, er kommet på avveie. Ingen vet akkurat hvor viruset befinner seg, men man vet at det er svært farlig, og svært smittsomt. Trusselen om en ukontrollert epidemi er tilstede. Dr Sam Daniels, som oppdaget viruset i Afrika, utkjemper en kamp mot tiden for å finne en utvei som kan stoppe spredningen av viruset som truer med å drepe hundre tusener. Han varsler sin eks-kone Robby, som arbeider ved et nasjonalt senter som skal hindre epidemier å spre seg. Men av uforklarlige grunner blir de begge bedt om å stoppe sitt arbeid. Sam og Robby ignorerer sine overordnede og setter i gang jakten på et anti-virus, men møter sterk motstand fra en høytstående militær offiser som for enhver pris vil holde viruset, og dets historie, strengt hemmelig for befolkningen.